南通职业技术学院的专业包括，电子商务、机械设计制造及自动化、计算机网络技术、财务会计、汽车检测与维修技术、市场营销、旅游管理、电子商务等。
该校有多个专业，其中电子商务是指通过各种形式的设备，如互联网、移动电话等，将产品和服务信息传送至消费者并完成实质性的贸易，机械设计制造及自动化是指学习机械设计、机械结构和原理、机械设备调试及维修，以及计算机控制、数控编程等，计算机网络技术是指研究计算机网络的基本知识，使学生掌握网络技术以实现网络交互，财务会计是指学习专业知识，如财务会计理论、国内财务会计、财务会计实务，以及税收等，汽车检测与维修技术是指学习汽车检测、维护、修理等相关技术，市场营销是指学习市场营销的知识，如市场营销策略、营销管理理论、产品营销等，旅游管理是指学习旅游及其相关行业的经营管理，如旅游资源开发、旅游客商合作等。
此外，该校还举办了一些其他类型的专业，如会计、贸易经济、国际商务、电子商务、物流管理、人力资源管理、行政管理、信息管理等。
